任何刺激呼吸系统或使其发炎的因素都会引起咳嗽。咳嗽是疾病的警示和特征，至少表明正在发生正常的生理反应，不应单纯地被视为坏事。咳嗽可能突然出现，也可能在猪群中持续存在。造成猪咳嗽的病原也有很多，包括放线杆菌，布氏杆菌，嗜血杆菌，巴氏杆菌，链球菌，支原体，猪流感病*，蓝耳病*或猪圆环病*2型。
任何刺激呼吸系统或使其发炎的因素都会引起咳嗽。但并非所有呼吸疾病都产生这种临床症状。猪慢性支气管肺炎常见的症状是生猪缓慢，而非咳嗽和呼吸困难。咳嗽通常表明导致咳嗽的病因尚处于早期阶段。
另外实际观察到猪总是只有一定比例的猪在咳嗽，在每次观察时，还并不一定是相同的猪，随着时间的推移，一部分猪会康复，另一部分猪则会感染。
咳嗽的形式可为诊断疾病提供参考。突然和大群爆发的咳嗽表明突然出现环境刺激或高度传染性的病原体。另一方面，猪群不断咳嗽可能表明存在长期的问题。
咳嗽是一种重要的防御性反射反应，旨在从呼吸道排出炎性分泌物和异物。如因任何原因抑制了咳嗽的机制，则系统就不能清除感染而变为慢性。
表1显示了与猪咳嗽或呼吸困难相关的感染性致病因子。最常见且最重要的以粗体显示。
除致病因子外，还必须了解导致猪咳嗽的其它因素（表2）。
表2.猪咳嗽的其它原因。
蛔虫感染也会造成咳嗽，因其会导致肺部的嗜酸性粒细胞炎症，因蛔虫生命周期的第三个幼虫阶段会通过肺组织迁移。幼虫迁移也可作为其它休眠细菌感染的触发因素。贫血的猪可能表现出呼吸困难，因很难弥补因循环红细胞和血红蛋白减少而导致的缺氧。它们更容易吸入异物，反过来又会引起咳嗽。若出现心功能不全，呼吸道分泌物不易从肺部清除，可能发生“心咳”。但这更可能与个体猪有关。
环境原因也相对常见。我个人知道有很多猪场在育成阶段发生咳嗽，但在屠宰场中几乎没有可见的病理病变。在这些情况下，气管的严重刺激以及肺保护机制的抑制将导致咳嗽。这种最常见原因是炎热和粉尘。与粉尘相关的其它空气污染物，如细菌内*素和真菌孢子。故解决猪咳嗽问题的方法必须是多方面找原因。
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